分子蒸餾技能應用的領域很廣，技能也越加老練。其應用特色有

1.可有效地脫除熱敏性物質中的輕分子物質產品物質的脫臭——姜油的脫臭產品物質的脫溶——辣椒紅色素脫溶產品物質中脫單體——酚醛樹脂中單體酚的脫除

2.脫除產品中的重物質及顏色

精密化學品中常有一些重分子物質、甚至金屬離子難以別離，分子蒸餾為此提供了有效辦法。乳酸精制，其它如芥酸、亞油酸、亞麻酸、二聚酸、芥酸酰胺、硬脂酸單甘酯、高碳醇的精制及脫色，也需要選用分子蒸餾技能。

3.下降熱敏性物質熱損傷

魚油乙酯脫色及濃縮，與傳統的釜式蒸餾比較，可明顯看出分子蒸餾技能的優勢：不只產品得率高，并且產品品質好，絕大多數的天然或合成香精香料都歸于熱敏性物質，均合適選用分子蒸餾技能提純。

4.改進傳統工藝，進行清潔出產魚油甘三酯精制，省去了傳統工藝中堿煉法脫酸，不但避免了皂化液對環境的污染，變廢為寶，并且提高了主產品質量。其它類似產品有小麥胚芽油、米糠油、椰子油、大豆油脫酸等。廢潤滑油回收，傳統工藝除去重雜質的辦法為硫酸法，該辦法對環境污染很大，而選用分子蒸餾技能則可避免污染，變廢為寶。